| 更新時間： | 2025-01-01 |
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| 所屬分類： | 蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn) |
| 報 價： | 500 |
提供商: 上海研謹(jǐn)生物服務(wù)名稱: 基于生物質(zhì)譜的蛋白鑒定、定量、翻譯后修飾分析服務(wù)： 2-5周規(guī)格: 實(shí)驗(yàn)服務(wù) 價格： 500元收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)/服務(wù)周期/提供結(jié)果:歡迎咨詢詳談，我們會根據(jù)您的方案及需求制定詳細(xì)的服務(wù)協(xié)議。更多實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)請瀏覽網(wǎng)站其他內(nèi)容,或來電詳詢!
基于生物質(zhì)譜的蛋白鑒定、定量、翻譯后修飾分析
實(shí)驗(yàn)原理
蛋白質(zhì)經(jīng)過蛋白酶的酶切消化后成肽段混合物，在質(zhì)譜儀中肽段混合物電離形成帶電離子,質(zhì)譜分析器的電場、磁場將具有特定質(zhì)量與電荷比值(即質(zhì)荷比, M/Z) 的肽段離子分離開來,經(jīng)過檢測器收集分離的離子,確定每個離子的MZ值。經(jīng)過質(zhì)量分析器可分析出每個肽段的MIZ.得到蛋白質(zhì)所有肽段的M/Z圖譜，即蛋白質(zhì)的--級質(zhì)譜峰圖。離子選擇裝置自動選取強(qiáng)度較大肽段離子進(jìn)行二級質(zhì)譜分析，輸出選取肽段的二級質(zhì)譜峰圖，通過和理論.上蛋白質(zhì)經(jīng)過胰蛋白酶消化后產(chǎn)生的--級質(zhì)譜峰圖和二級質(zhì)譜峰圖進(jìn)行比對而鑒定蛋白質(zhì)。根據(jù)離子源的不同，目前用于蛋白分析的主流質(zhì)譜技術(shù)主要有電噴霧離子化質(zhì)譜(ESHMS) 和基質(zhì)輔助激光解析電離質(zhì)譜(ML ADHMS)。質(zhì)量分析器主要有四極桿分析器(QE).離 子阱分析器(Orbitrap)、飛行時間分析器 (MLADI-TOF) 。
生物質(zhì)譜在蛋白分析方面的應(yīng)用
1.蛋白鑒定:由于各種蛋白質(zhì)的氨基酸序列(--級結(jié)構(gòu))不同，蛋白質(zhì)被酶解后產(chǎn)生的肽段序列也各異，肽混合物質(zhì)量數(shù)亦具有特征性，稱為肽質(zhì)量指紋譜(peptide mass fingerprint, PMF) ，可用于蛋白質(zhì)的鑒定。
2.蛋白定量:基于穩(wěn)定同位素標(biāo)記法，如SIL AC. QconCAT. iTRAQ等;基于質(zhì)譜歸--化的非標(biāo)定量法，如蛋白豐度指數(shù)法PAI、多肽匹配數(shù)、譜圖計數(shù)、碎片離子峰強(qiáng)度(iBAQ) , SWATH等。
3.蛋白翻譯后修飾:根據(jù)特定修飾基團(tuán)的圖譜特點(diǎn)進(jìn)行翻譯后修飾的鑒定和定位，包括磷酸化、糖基化、巰基和二硫鍵定
位、乙?；?、泛素化等。
實(shí)驗(yàn)步驟
①組織或細(xì)胞蛋白提取;
②蛋白酶消化，將蛋白樣品制備成多肽;
③多肽抽提和質(zhì)譜儀分析，產(chǎn)生肽段質(zhì)荷比和肽離子質(zhì)量;
④搜庫、打分、輸出排序;
⑤搜庫后分析，蛋白鑒定、定量或翻譯后修飾分析。
實(shí)驗(yàn)完成周期及交付標(biāo)準(zhǔn)
1.實(shí)驗(yàn)完成周期10~30天,
2.交付標(biāo)準(zhǔn):
①主要儀器、試劑和實(shí)驗(yàn)方法:
②包含protein ID. gene symbol. spectrum count. u-peptide. z-score.、 coverage等信息的蛋白鑒定列表;
③所有肽段信息表;
④質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)(raw data)。
需確認(rèn)的信息
1.樣品:①如果樣品為蛋白質(zhì)溶液，蛋白質(zhì)總量≥300mg ;
②.如果是組織樣品，樣品總量≥0.1g;如果是細(xì)胞樣品，細(xì)胞數(shù)量≥107個;
③、如果是體液樣品，血清≥200ml,腦脊液≥200ml,尿液≥1ml, 淚液≥1ml;
2.樣品采集過程中使用到塑料制品時，盡量使用無色產(chǎn)品，以減少塑料制品中雜質(zhì)對質(zhì)譜檢測的影響;
3.確認(rèn)樣品所屬種屬、分析需求。
文獻(xiàn)參考
[1]Liu Q, et al. In-depth proteomic characterization of endogenous nuclear receptors in mouse liver. Mol Cell Proteomics.2013;12(2):473-84.
[2]Ruprecht B, et al. MALDI-TOF and nESI Orbitrap MS/MS identify orthogonal parts of the phosphoproteome.
Proteomics.2016;16(10);:1447-56.
[3]Kobayashi D, et al. Identification of a specific translational machinery via TCTP-EF1A2 interaction regulating NF1-associated tumor growth by afinity purification and data-independent mass spectrometry acquisition (AP-DIASWATH).Mol Cell Proteomics.2018 Oct 31. PubMed PMID: 30381327.
實(shí)驗(yàn)代做服務(wù)：
ELISA試劑盒免費(fèi)代檢測 | CCK8檢測 | 基因組DNA提取
| 蛋白相互作用分析 |
Western Blot
| 免疫組化 | 熒光定量PCR | 動物模型服務(wù) |
流式細(xì)胞檢測 | 細(xì)胞增殖 | 激光共聚焦 | DNA甲基化實(shí)驗(yàn) |
細(xì)胞劃痕 | 鈣離子濃度檢測 | 掃描電鏡實(shí)驗(yàn) | microRNA 測序 |
動物實(shí)驗(yàn) | Taqman探針 | ATP/ADP檢測
| 石蠟/冰凍切片 |
定點(diǎn)突變 | 線粒體膜電位(MMP)檢測 | 細(xì)胞生長曲線的測定 | 藥理毒理動物實(shí)驗(yàn)
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免疫共沉淀 | 真核表達(dá)載體構(gòu)建 | 染色質(zhì)免疫沉淀CHIP | 非標(biāo)定量（Label-free）實(shí)驗(yàn) |
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